يتألف مجلس الإدارة الذي يترأسه رئيس الحكومة أو السلطة الحكومية المفوضة من لدنه لهذا الغرض، من :
- السلطة الحكومية المكلفة بالتعليم العالي والبحث العلمي أو من يمثلها ؛
- السلطة الحكومية المكلفة بالمالية أو من يمثلها ؛
- رئيس المجلس الأعلى للتربية والتكوين والبحث العلمي أو من يمثله ؛
- أمين السر الدائم لأكاديمية الحسن الثاني للعلوم والتقنيات أو من يمثله ؛
- مدير المركز الوطني للبحث العلمي والتقني أو من يمثله ؛
- مدير الوكالة الوطنية لإنعاش التشغيل والكفاءات أو من يمثله ؛
- رئيس الاتحاد العام لمقاولات المغرب أو من يمثله ؛
- ممثل عن المؤسسات القطاعية للتعليم العالي ؛
- ممثل عن المؤسسات الخاصة للتعليم العالي ؛
- أربعة أساتذة باحثين ؛
- ممثل واحد منتخب من لدن ومن بين مستخدمي الوكالة.
تحدد بمرسوم كيفيات تعيين وانتخاب الأعضاء المشار إليهم في البنود 8 و9 و10 و11، وكذا مدة انتدابهم.
يمكن لرئيس مجلس الإدارة أن يدعو للمشاركة في اجتماعات المجلس، على سبيل الاستشارة، كل شخص ذاتي أو اعتباري من القطاع العام أو الخاص يرى فائدة في حضوره، وكلما دعت الضرورة إلى ذلك.
