يتمتع مجلس الإدارة بكل الصلاحيات والمسؤوليات الضرورية لإدارة الوكالة. وعليه، فإنه يمارس الصلاحيات التالية:
- يحدد التوجهات الكبرى للوكالة برنامج عملها،
- يحدد الميزانية السنوية للوكالة وطريقة تمويل برامجها أنشطتها ونظام استهلاك وجدولة الميزانية،
- إصدار حسابات الوكالة ويقرر توزيع النتائج،
- يقترح على الإدارة معايير التقييم،
- يقوم بصياغة منظام الوكالة بحيث يحدد الهياكل التنظيمية وصلاحياتهم،
- صياغة النظام الأساسي لمستخدمي الوكالة ونظام تعويضاتهم،
- صياغة قانونه الداخلي وكذا القانون الداخلي للوكالة،
- صياغة النظام المحدد لشروط وصيغ تفويت الصفقات،
- تحديد جدول أسعار الخدمات تقدمها الوكالة،
- المصادقة على اتفاقيات الشراكة والتعاون المبرمة مع المنظمات الوطنية والأجنبية،
- اتخاذ قرار حيازة الممتلكات العقارية ونقلها وتأجيرها من لدن الوكالة،
- قبول الهبات والتبرعات،
يمكن لمجلس الإدارة تفويت تسوية القضايا أعلاه إلى مدير الوكالة. ويقوم مجلس الإدارة بالاطلاع على التقرير السنوي لأنشطة الوكالة الذي يعده المدير.
